2015年1月26日,科技部張來武副部長(zhǎng)一行來到了位于浦東孫橋現(xiàn)代農(nóng)業(yè)園區(qū)的AgriPhenoTM平臺(tái),對(duì)這個(gè)亞洲唯一的高通量植物基因型-表型-育種服務(wù)平臺(tái)進(jìn)行了考察。
隨著基因組學(xué)的快速發(fā)展,研究人員發(fā)現(xiàn)了許多與抗逆、高產(chǎn)、高效(利用水分、營(yíng)養(yǎng)鹽)功能相關(guān)的備選基因,加速了新功能基因的發(fā)掘和新植物品種的構(gòu)建,這些品種/種質(zhì)是人類未來發(fā)展的巨大財(cái)富。如何對(duì)植物表型進(jìn)行高通量地測(cè)量和分析是目前研究新性狀和新品種的限制因素。新品種選育受到慢且主觀的手工表型分析的困擾,以更高的精度和速度將基因功能、植物表型和環(huán)境應(yīng)答聯(lián)系起來,這種需求比任何時(shí)候更加迫切。
表型組學(xué)可以利用目標(biāo)群體詳細(xì)的表型信息為功能基因組學(xué)提供良好的研究工具。國(guó)際上一些公司和研究機(jī)構(gòu)為了搶占先機(jī),投入大量的資金和人力用于建設(shè)表型組學(xué)平臺(tái),如先鋒,孟山都、先正達(dá)、拜耳、巴斯夫、英國(guó)國(guó)家植物表型組學(xué)中心,歐洲植物表型組平臺(tái),澳洲植物表型組學(xué)中心等等。
近年來,我國(guó)在植物科學(xué)領(lǐng)域取得了不少進(jìn)步,尤其是在重要的農(nóng)作物研究上如水稻基因組學(xué)、功能基因、水稻突變體庫(kù)、遺傳育種等,在國(guó)際上具有重要的學(xué)術(shù)地位。然而我們的大部分研究還停留在基因?qū)用娴难芯?,不能全面、徹底地闡明作物的生理功能,特別是作物表型與其產(chǎn)量、生理狀態(tài)之間的相互關(guān)系,以及不同的環(huán)境條件對(duì)作物生長(zhǎng)狀況、產(chǎn)量、種質(zhì)質(zhì)量等的影響。這就需要對(duì)作物進(jìn)行表型組學(xué)的研究,通過研究不同的表型性狀來確定作物的遺傳性狀,并且尋找不同環(huán)境因子對(duì)作物各種指標(biāo)影響的閾值,從而能夠更加科學(xué)地闡明作物生長(zhǎng)機(jī)理,指導(dǎo)作物生產(chǎn)。
AgriPhenoTM平臺(tái)擁有國(guó)際上最先進(jìn)的價(jià)值數(shù)千萬元的高通量表型設(shè)備,而這種高通量表型設(shè)備是制約現(xiàn)代分子育種、基因及性狀挖掘、功能基因組學(xué)等發(fā)展的瓶頸之一。AgriPhenoTM是一個(gè)公共科研服務(wù)平臺(tái),客戶不需投入巨資去建設(shè)平臺(tái),只需設(shè)計(jì)好實(shí)驗(yàn),花費(fèi)少量的經(jīng)費(fèi)即可完成研究或育種工作。
AgriPhenoTM平臺(tái)采用“溫室自動(dòng)化 + 高通量成像”技術(shù),將機(jī)器人技術(shù)、圖像分析和大規(guī)模計(jì)算能力完美結(jié)合,對(duì)大量植株進(jìn)行全自動(dòng)、高通量的植物表型測(cè)量。該表型平臺(tái)包括傳送帶、成像模塊、“暗房”、運(yùn)輸車、澆水和稱重裝置、控制系統(tǒng)等。其中傳送帶、運(yùn)輸車和植物在溫室中運(yùn)轉(zhuǎn),所有的植物可以由軟件控制在傳送帶上進(jìn)行動(dòng)態(tài)分布,以避免由于溫室中的光、溫、濕分布不均勻造成的影響;成像模塊、“暗房”、澆水和稱重裝置安裝在獨(dú)立的空調(diào)房中,并通過傳送帶與溫室相連。該平臺(tái)可以高通量獲取植物葉片長(zhǎng)度、寬度、葉角度、葉面積,植株莖干直徑,植株高度、寬度和密度,植株生長(zhǎng)速率,植株脅迫環(huán)境下的色素變化,植株緊湊性(葉角度和緊密性),植株和葉片的顏色分析,包含發(fā)育狀態(tài)、病理學(xué)等信息,植株節(jié)間高度,植株葉片卷曲程度、葉傾角,植物水分生理等等表型參數(shù)。
張副部長(zhǎng)對(duì)AgriPhenoTM平臺(tái)給予了高度肯定,并鼓勵(lì)澤泉科技把平臺(tái)建設(shè)好,為促進(jìn)我國(guó)農(nóng)業(yè)育種的快速發(fā)展發(fā)揮助推器的作用。
科技部社會(huì)發(fā)展科技司、農(nóng)村科技司、中國(guó)生物技術(shù)發(fā)展中心、上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)、孫橋現(xiàn)代農(nóng)業(yè)園區(qū)等單位的領(lǐng)導(dǎo)陪同張副部長(zhǎng)一同進(jìn)行了考察。