葡萄，是全世界最為廣泛種植的經(jīng)濟作物之一，作為水果、釀酒原料，葡萄種植始終伴隨人類文明。那么，人類最早栽種葡萄的時間是什么時候？釀酒葡萄和鮮食葡萄的起源一樣嗎？這些問題的答案，學術界此前一直多有爭論。
云南農業(yè)大學作為第一單位在《Science》上發(fā)表題目為“Dual domestications and origin of traits in grapevine evolution”的文章，該研究由云南農業(yè)大學牽頭，匯集26個國家和地區(qū)70多名科學家完成的大型國際合作項目，形成了葡萄起源、遷徙、品種分化研究領域的多個重要結論，為葡萄基因組輔助育種、品種溯源提供了重要參考數(shù)據(jù)集，對葡萄種質資源挖掘，推動產業(yè)發(fā)展具有重大意義，標志著我國葡萄生物資源研究達到世界領先地位。該論文被Science選為當期封面論文，并受邀參加2023年3月Science期刊年會推薦論文。Science同期還刊發(fā)了題為“Two domestications for grapes”的評論文章，對該研究進行了介紹并給予了高度評價。
該研究成果提出和闡釋了幾個重要觀點：
1、論證栽培葡萄起源的時間大約在距今1.1萬年前，遠比此前人類認知的起源時間要早，表明葡萄是最早馴化的水果，為研究作物起源馴化、葡萄栽培考古學研究提供了重要線索
2、揭示栽培葡萄馴化中心為兩個，為雙起源中心模式，糾正了此前的單起源中心理論，是葡萄研究的重要里程碑結果；
3、證明釀酒葡萄和鮮食葡萄在不同區(qū)域同時起源，并且起源初期遺傳背景就具有重大的差異，徹底解決了學術界對鮮食葡萄和釀酒葡萄起源長達數(shù)百年的爭議；
4、構建幾乎覆蓋所有栽培葡萄遺傳資源高精度親緣關系譜系圖，可以實現(xiàn)葡萄品種的定向育種和設計育種；
5、發(fā)現(xiàn)了大量的葡萄人工馴化形狀控制基因，特別是找到了釀酒葡萄和鮮食葡萄人工馴化的差異基因，為葡萄功能基因組學研究和育種提供素材；
6、在此研究基礎上，結合人類活動、歷史氣候變遷等因素，繪制了葡萄起源和人工馴化、改良的全景圖。
上述研究解決了葡萄研究領域的諸多爭議，我國是世界鮮食葡萄的重要產區(qū)，云南是我國重要的早熟鮮食葡萄產區(qū)，但葡萄產業(yè)發(fā)展卻因“種業(yè)”問題受制于人。立足該成果對葡萄的經(jīng)濟性狀控制基因的全面解析，可建立葡萄基因組輔助育種技術，在短期內突破葡萄種業(yè)難題，為我國葡萄產業(yè)高質量發(fā)展保駕護航。
綜上所述，該研究通過大量測序、全基因組關聯(lián)分析等技術手段解釋了葡萄的馴化起源，對葡萄育種有著里程碑式的意義。
2 Allaby RG. Two domestications for grapes[J]. Science, 2023, 379(6635): 880-881.
Agripheno?高通量基因分型檢測平臺包括高通量Oktopure DNA提取儀、Nexar?模塊化內聯(lián)液處理與分析系統(tǒng)、Soellex?高通量PCR水浴熱循環(huán)系統(tǒng)和Araya?內聯(lián)熒光檢測系統(tǒng)。Oktopure DNA提取儀采用磁珠的方法提取DNA，通量達到800個樣本/3小時。同時，適用于多種樣本類型的DNA提取，包括植物葉片、種子，毛發(fā)、血方卡、精液、口拭子、唾液、組織等。提取的DNA適用于多種下游應用，如基因分型、一代測序、二代測序等。Nexar高通量吸取樣品DNA和引物、mix至384孔卷帶并封膜。Soellex對封膜完成的卷帶進行PCR水浴熱循環(huán)，每次最多可達230,000個樣本。Araya對水浴完成的卷帶掃描分析，28秒掃描一張卷帶。Agripheno?基因分型采用KASP（Kompetitive Allele Specific PCR）原理，對目標SNPs和InDels進行精準的雙等位基因分型。反應體系僅1.6μl，具有高通量、低成本，準確率和檢出率接近100%的明顯優(yōu)勢。
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DNA提取服務
根據(jù)目標DNA/基因序列,可開發(fā)高效的分子標記（SNP-KASP、SSR等），并可實現(xiàn)單日最高一萬SSR數(shù)據(jù)點，以及數(shù)以十萬計的SNP數(shù)據(jù)點檢測。
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靶向測序技術主要分為基于多重PCR的靶向基因捕獲技術（GenoPlexs）和基于液相探針雜交的靶向基因捕獲技術（GenoBaits）兩種?？赏瓿蓡螛悠?0-5000和3000-40000標記的基因型分析，并達到可設計區(qū)域覆蓋度高于95%，擴增子均一性高于90%的捕獲效率。
GenoPlex基于多重PCR的靶向基因捕獲技術方案
GenoBaits基于液相探針雜交的靶向基因捕獲技術方案
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